在运输过程中，鱼最有可能因反复的辗转反侧(如搬运和碰撞)而受伤或死亡。

如何减少子代甚至亲鱼在运输过程中的死亡，提高成活率是一个主要问题。靠近河流、湖泊、水库等水源的农民可以使用网箱整体运输鱼类，可以减少甚至防止鱼类死亡的发生，提高养殖成活率，减少药物防治的成本损失。

运输的要点是：

1)在培育鱼茧时，鱼苗准备在网笼中培育(在河流、湖泊和水库的网笼中)。养殖鱼苗的网箱不宜过大，以免造成整体运输的麻烦。充分注意运输路线的安全。

2)养殖鱼苗(包括鱼种和亲鱼)的网箱应做成上下有整体框架的浮式网箱，以方便水上运输。

3)当天气晴朗时，用船拉网笼并整体运输。运输作业，送好水，有丰富的船舶和水上押运经验。船的速度不应该太快。使用中高档位的节气门支架进行驱动。

4)运输前一天停止给鱼苗和鱼种喂食。

用该方法运输的鱼苗、鱼种、亲鱼甚至食用鱼无碰撞、无冲击、无伤害，运输后成活率高，养殖过程中不会因运输问题导致疾病，经济效益好。